Дутикова Ю.В., Борисова О.Ф., Щелкина А.К., Lin J., Huang S., Штиль А.А., Калюжный Д.Н.
5,10,15,20-тетра-(N-метил-3-пиридил)порфирин (TMPyP3) представитель ДНК-связывающих производных порфиринов. Проведено сравнительное исследование характера связывания этого лиганда с биологически значимыми структурами ДНК. С этой целью изучено взаимодействие TMPyP3 с антипараллельным теломерным G-квадруплексом d(TTAGGG)4, олигонуклеотидом dTTAGGGTTAGAG(TTAGGG)2, не образующим квадруплексную структуру, двухцепочечными d(AC)8 · d(GT)8 и одноцепочечными d(AC)8 и d(GT)8 молекулами ДНК. Анализ изотерм адсорбции показал, что константы и число мест связывания комплексов TMPyP3 : ДНК увеличивались в ряду d(AC)8 < d(GT)8 < d(AC)8 · d(GT)8 = d(TTAGGG)4 < dTTAGGGTTAGAG(TTAGGG)2. Впервые установлено, что константа связывания TMPyP3 с развернутой нитью dTTAGGGTTAGAG(TTAGGG)2 (1.3 ? 107 M-1) примерно в 3 раза больше, чем с G-квадруплексом d(TTAGGG)4 (4.7 ? 106 M-1). Адсорбция двух молекул TMPyP3 на d(TTAGGG)4 понижала термостабильность G-квадруплекса ( Тпл = 8°С). Спектры кругового дихроизма комплексов TMPyP3 с d(TTAGGG)4 свидетельствовали о частичном разворачивании лигандом G-квадруплексной структуры. Дестабилизация структуры теломерного квадруплекса в комплексе с TMPyP3 может объяснить относительно низкую активность этого лиганда как ингибитора теломеразы и индуктора гибели опухолевых клеток.
